急性乙肝一般不被治疗，因为在90%至95%的情况下病情自然消失。

针对慢性乙肝有多种药物：岣扇潘亍?EG干扰素、恩替卡韦、拉米夫定、替比夫定和阿德福韦。此外还有其它药物目前正在试验阶段。不过这些药物都不能基本乙肝，而是控制乙肝的发展、防止后果症状。在3%以下的情况下干扰素可以达到血液内不存在HBsAg抗原，这实际上已经相当于了。医生决定哪些病人何时使用哪些药物来治疗。在病情不重的情况下一般仅对病情发展进行监视。在肝脏受损的情况下治疗是必须的（以上数据为2006年1月的数据）。在这里也是由医生来判断应该使用什么措施。PEG干扰素治疗一年之后，后续的观察当中HBsAg抗原转阴率逐年提升，之后已上升到11%。这是人类至目前为止对乙肝的治疗方式。血液HBsAg转阴的患者身上，肝仍可侦测到病毒的核酸，恢复的定义仍有待进一步的确认。